MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251

Total Repeats: 13257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017349	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017349	AC	4	8	148	155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017349	AGA	2	6	171	176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017349	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017349	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017349	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017349	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017349	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017349	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017349	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017349	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017349	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017349	TA	3	6	1908	1913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017349	TAA	3	9	1921	1929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017349	T	6	6	1936	1941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017349	AC	3	6	2009	2014	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017349	CCA	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017349	CTA	3	9	2090	2098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017349	TA	3	6	2118	2123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017349	TA	4	8	2126	2133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017349	ATAAAT	2	12	3294	3305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017349	ATTA	2	8	3319	3326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017349	T	6	6	3342	3347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017349	AAAT	2	8	3376	3383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017349	TAA	2	6	3449	3454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017349	TTTAAA	2	12	3471	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017349	A	6	6	3539	3544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017349	A	6	6	3565	3570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017349	AATT	2	8	3575	3582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017349	A	7	7	3631	3637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017349	AT	3	6	3644	3649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017349	ATT	2	6	3675	3680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017349	TGAAC	2	10	6977	6986	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017349	AGG	2	6	6993	6998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017349	A	7	7	9669	9675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017349	TAA	2	6	9746	9751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017349	AT	3	6	10621	10626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017349	TAT	2	6	10646	10651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017349	ATT	3	9	10666	10674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017349	ATT	2	6	10732	10737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017349	ACA	2	6	10748	10753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017349	ATA	2	6	10791	10796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017349	AAG	2	6	10851	10856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017349	TAA	2	6	12476	12481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017349	AT	3	6	12504	12509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017349	AG	3	6	12523	12528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017349	AT	4	8	12557	12564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017349	CTAC	2	8	12569	12576	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017349	T	7	7	12708	12714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017349	A	6	6	12722	12727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017349	ACGT	2	8	12733	12740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017349	ATA	2	6	12747	12752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017349	ATT	2	6	12760	12765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017349	TA	3	6	14098	14103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017349	ATA	2	6	14140	14145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017349	GTG	2	6	14155	14160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017349	T	7	7	14177	14183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017349	AAC	2	6	14219	14224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017349	CAA	2	6	14272	14277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017349	ATG	2	6	14290	14295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017349	TAT	2	6	14335	14340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017349	A	6	6	14356	14361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017349	GTA	2	6	14376	14381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017349	GTAGG	2	10	14399	14408	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017349	G	7	7	14407	14413	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017349	ATG	2	6	14414	14419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017349	TCA	2	6	14457	14462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017349	A	6	6	14472	14477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017349	TAAA	2	8	14536	14543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017349	TAT	2	6	14669	14674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017349	T	6	6	14674	14679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017349	TA	3	6	14686	14691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017349	AGG	2	6	14707	14712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017349	AAC	2	6	15881	15886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017349	TCA	2	6	15908	15913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017349	CTT	2	6	16052	16057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017349	T	7	7	16079	16085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017349	AGG	2	6	16091	16096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017349	TA	3	6	17079	17084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017349	TAAATC	2	12	17163	17174	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017349	AAT	2	6	17202	17207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017349	CA	3	6	17225	17230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017349	TTA	2	6	17276	17281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017349	ATA	2	6	17345	17350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017349	AAT	2	6	22178	22183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017349	AT	3	6	22233	22238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017349	TGA	2	6	22260	22265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017349	TATT	2	8	22315	22322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017349	TA	3	6	23728	23733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017349	AGG	2	6	23782	23787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017349	TCGAT	2	10	23811	23820	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017349	A	6	6	23830	23835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017349	AGA	2	6	23872	23877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017349	GAT	2	6	23881	23886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017349	AAG	2	6	23921	23926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017349	A	6	6	24001	24006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017349	ATT	2	6	24014	24019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017349	ATA	2	6	24020	24025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017349	TTC	2	6	24065	24070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017349	ATA	2	6	24075	24080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017349	A	6	6	24093	24098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017349	ATCT	2	8	24131	24138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017349	CGG	2	6	24189	24194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017349	T	6	6	24227	24232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017349	GCCT	2	8	24259	24266	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017349	T	7	7	24335	24341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017349	ATATT	2	10	24349	24358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017349	TTA	2	6	24493	24498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017349	TTC	2	6	24530	24535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017349	CCA	2	6	24547	24552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017349	AAT	2	6	24584	24589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017349	ATTT	2	8	24593	24600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017349	GTGGGA	2	12	24614	24625	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017349	ATTT	2	8	24647	24654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017349	CGT	2	6	24655	24660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017349	ATT	2	6	24678	24683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017349	CTA	2	6	24704	24709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017349	GCCCC	2	10	24717	24726	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
119	NC_017349	C	8	8	24723	24730	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_017349	ATTTC	2	10	24750	24759	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017349	A	6	6	24795	24800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017349	ACT	2	6	24831	24836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017349	TAT	2	6	24900	24905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017349	TCA	2	6	24919	24924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017349	TAA	2	6	24964	24969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017349	A	6	6	24968	24973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017349	AT	3	6	24979	24984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017349	TA	3	6	25030	25035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017349	T	6	6	25104	25109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017349	A	6	6	25134	25139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017349	ATA	2	6	25147	25152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017349	TAA	2	6	29849	29854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017349	TCA	2	6	29870	29875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017349	TAT	2	6	29913	29918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017349	TAA	2	6	30035	30040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017349	CATT	2	8	30047	30054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017349	ATA	2	6	30109	30114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017349	AG	4	8	30199	30206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017349	CTG	2	6	31055	31060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017349	T	6	6	31082	31087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017349	TGT	2	6	31089	31094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017349	TGG	2	6	31095	31100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017349	TGT	2	6	31109	31114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017349	A	6	6	31141	31146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017349	AAT	2	6	31173	31178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017349	ATCA	2	8	31188	31195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017349	ATA	2	6	31215	31220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017349	AT	3	6	33574	33579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017349	TAC	2	6	33589	33594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017349	T	7	7	33625	33631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_017349	CTC	2	6	61371	61376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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